在太平洋和大西洋之间的一个小岛――巴库里附近，经常莫明其妙地发生各类船只失踪、沉没事件，先锋号潜水艇奉命去调查这一离奇事件可是就在先锋号即将启程的前夜，先锋号启程的时间，到达的地点等绝密情报却意外地泄露出去。两个嫌疑犯一个诈死逃脱，一个上了即将出发的先锋号潜水艇。苏联公安人员兵分两路，一路经过周密探查，在一家旅馆逮捕了发报人伊万绍夫。另一路在先锋号船长瓦伦佐夫的带领下，透过重重迷雾，终于一举抓获埋藏多年的破坏分子工程师果烈洛夫，捣毁了敌对分子长期经营的发射基地和发报点。也解开了这一地区，长期以来，不断发生船只沉没、失踪的秘密，也就是所谓两个海洋的秘密。